{"id":11525,"date":"2020-12-23T09:21:20","date_gmt":"2020-12-23T08:21:20","guid":{"rendered":"https:\/\/semexpkbb.com\/?p=11525"},"modified":"2026-02-21T07:34:13","modified_gmt":"2026-02-21T06:34:13","slug":"mennyire-stabilak-a-genomikai-tesztek","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/mennyire-stabilak-a-genomikai-tesztek\/","title":{"rendered":"Mennyire stabilak a genomikai tesztek?"},"content":{"rendered":"

Az emberi DNS szekven\u00e1l\u00e1s\u00e1n (dek\u00f3dol\u00e1s\u00e1n) v\u00e9gzett munka 2001-ben ker\u00fclt publik\u00e1l\u00e1sra. Nagyon hamar, m\u00e1r 2002-ben a genetikusok felismert\u00e9k, hogy a g\u00e9nek elemz\u00e9s\u00e9nek a szarvasmarh\u00e1n\u00e1l is lehet gyakorlati alkalmaz\u00e1sa, \u00e9s megindultak a kutat\u00e1sok.<\/strong><\/p>\n

<\/p>\n

\"\"<\/p>\n

E munka eredm\u00e9nye ma a szarvasmarh\u00e1k genomikai elemz\u00e9sek\u00e9nt ismert. Ez egy olyan m\u00f3dszer, amely az \u00e1llat genetikai potenci\u00e1lj\u00e1t a DNS-\u00e9nek elemz\u00e9se \u00e9s a sz\u00e1rmaz\u00e1si adatok elemz\u00e9s\u00e9nek kombin\u00e1ci\u00f3j\u00e1val hat\u00e1rozza meg. Az elm\u00falt 10 \u00e9vben a genomikai szelekci\u00f3 korszaka \u00e9s a genomikusan tesztelt bik\u00e1k intenz\u00edv haszn\u00e1lata gyorsabb \u00e9s nagyobb genetikai el\u0151rehalad\u00e1st hozott, amit a fenti \u00e1bra is szeml\u00e9ltet.<\/strong><\/p>\n

Ugyanakkor az is igaz, hogy a genomikai bik\u00e1k tesztjeinek megb\u00edzhat\u00f3s\u00e1ga alacsonyabb, mint a le\u00e1nyokon tesztelt bik\u00e1k\u00e9. Ez\u00e9rt jogosan mer\u00fclnek fel a k\u00e9rd\u00e9sek: mennyire stabilak \u00e9s megb\u00edzhat\u00f3ak a genomikai tesztek, \u00e9s hogyan, illetve mikor \u00e9rdemes genomikai bik\u00e1kat haszn\u00e1lni?<\/strong> Mivel ez a szelekci\u00f3s m\u00f3dszer a holstein fajt\u00e1ban terjedt el legink\u00e1bb \u00e9s itt jutott a legmesszebbre, a v\u00e1laszt a holstein bik\u00e1k \u00e9s a mesters\u00e9ges term\u00e9keny\u00edt\u00e9si ipar\u00e1g teszteredm\u00e9nyeinek elemz\u00e9s\u00e9n kereszt\u00fcl igyekszem megadni.<\/p>\n

A genomikai tesztek stabilit\u00e1s\u00e1nak bemutat\u00e1s\u00e1ra a PEAK Genetics genetikus szakembere, E\u0161li Mik\u0161ovski (Ashley Mikshowsky)<\/strong> k\u00f6zel 7 800 holstein bika adatait elemezte. Ezeknek a bik\u00e1knak a sperm\u00e1j\u00e1t 2010 janu\u00e1rja \u00e9s 2016 decembere k\u00f6z\u00f6tt haszn\u00e1lt\u00e1k, amikor m\u00e9g csak genomikusan voltak tesztelve \u2013 ma m\u00e1r mindegyik\u00fck le\u00e1nyok alapj\u00e1n is tesztelt. Munk\u00e1j\u00e1nak eredm\u00e9nyei az 1. \u00e9s 2. grafikonon l\u00e1that\u00f3k.<\/p>\n

    \n
  1. Mindk\u00e9t grafikonon a s\u00f6t\u00e9tk\u00e9k vonal a TPI-index (1. grafikon) vagy az NM$-index (2. grafikon) \u00e1tlagos \u00e9rt\u00e9k\u00e9t mutatja a bik\u00e1k els\u0151 genomikai tesztje alapj\u00e1n<\/strong>.<\/li>\n
  2. A vil\u00e1gosk\u00e9k vonal ugyanazon bik\u00e1k TPI-index\u00e9nek (1. grafikon) vagy NM$-index\u00e9nek (2. grafikon) \u00e1tlagos \u00e9rt\u00e9k\u00e9t mutatja 2020 \u00e1prilis\u00e1b\u00f3l, amikor ezek a bik\u00e1k m\u00e1r le\u00e1nyok alapj\u00e1n voltak tesztelve.<\/strong><\/li>\n
  3. A k\u00e9t vonal k\u00f6z\u00f6tti t\u00e1vols\u00e1g a TPI-index (1. grafikon) vagy az NM$-index (2. grafikon) \u00e1tlagos v\u00e1ltoz\u00e1s\u00e1t jelenti az els\u0151 genomikai tesztt\u0151l a progeny tesztig (le\u00e1nytesztig).<\/strong><\/li>\n<\/ol>\n

    1. grafikon \u2013 A TPI-index \u00e1tlagos v\u00e1ltoz\u00e1sa az els\u0151 genomikai tesztt\u0151l a 2020. \u00e1prilisi (le\u00e1nyok alapj\u00e1n v\u00e9gzett) tesztig<\/u><\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    Ahogy l\u00e1thatjuk: a grafikon bal oldal\u00e1n azok a bik\u00e1k szerepelnek, amelyek els\u0151 genomikai tesztje 2010 janu\u00e1rj\u00e1ban k\u00e9sz\u00fclt, \u00e9s ezekn\u00e9l a 2020 \u00e1prilisi le\u00e1nytesztben 200 TPI ponttal alacsonyabb \u00e9rt\u00e9k l\u00e1that\u00f3. A fiatalabb bik\u00e1kn\u00e1l, amelyek els\u0151 genomikai tesztje 2016 december\u00e9ben k\u00e9sz\u00fclt, a TPI-index k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9ge az els\u0151 genomikai teszt \u00e9s a 2020 \u00e1prilisi le\u00e1nyteszt k\u00f6z\u00f6tt m\u00e1r csak 91 pont.<\/p>\n

    Ez azt jelenti, hogy a genomikai tesztek stabilit\u00e1sa h\u00e9t \u00e9v alatt (2010 janu\u00e1rj\u00e1t\u00f3l 2016 december\u00e9ig) t\u00f6bb mint k\u00e9tszeres\u00e9re javult. A genomikai tesztek ma pontosabbak, b\u00e1r \u00e1tlagosan m\u00e9g mindig kiss\u00e9 fel\u00fclbecs\u00fclik az \u00e1llat genetikai potenci\u00e1lj\u00e1t. A stabilit\u00e1s n\u00f6veked\u00e9s\u00e9nek trendje arra utal, hogy a k\u00f6vetkez\u0151 id\u0151szakban tov\u00e1bbi cs\u00f6kken\u00e9s v\u00e1rhat\u00f3 a genomikai \u00e9s a le\u00e1nytesztek k\u00f6z\u00f6tti k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9gben, ami m\u00e9g gyorsabb genetikai el\u0151rehalad\u00e1st tehet lehet\u0151v\u00e9.<\/strong><\/p>\n

    2. grafikon \u2013 Az NM$-index \u00e1tlagos v\u00e1ltoz\u00e1sa az els\u0151 genomikai tesztt\u0151l a 2020. \u00e1prilisi (le\u00e1nyok alapj\u00e1n v\u00e9gzett) tesztig<\/u><\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    Hasonl\u00f3 a helyzet akkor is, ha a Net Merit $ indexet (NM$) \u00e9s a 2. grafikont vizsg\u00e1ljuk. A 2010 janu\u00e1rj\u00e1ban genomikusan tesztelt bik\u00e1k 2020 \u00e1prilis\u00e1ig \u00e1tlagosan 112 NM$ indexpontot estek. Ezzel szemben a fiatalabb bik\u00e1k, amelyek els\u0151 genomikai tesztje 2016 december\u00e9ben k\u00e9sz\u00fclt, 2020 \u00e1prilis\u00e1ig \u00e1tlagosan csak 37 NM$ indexpontot estek. B\u00e1r a genomikai tesztekb\u0151l sz\u00e1rmaz\u00f3 \u00f6ssz-teny\u00e9sz\u00e9rt\u00e9kek fel\u00fclbecs\u00fcltek, a genomikai \u00e9s a le\u00e1nytesztek k\u00f6z\u00f6tti k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9g ebben az esetben is cs\u00f6kkent az elemz\u00e9sek kezdeti id\u0151szak\u00e1hoz k\u00e9pest.<\/p>\n

    Ha m\u00e9g mindig k\u00e9telkedik a genomikai elemz\u00e9sek megb\u00edzhat\u00f3s\u00e1g\u00e1ban \u00e9s stabilit\u00e1s\u00e1ban, \u00e9rdemes m\u00e1s szemsz\u00f6gb\u0151l is megvizsg\u00e1lni a k\u00e9rd\u00e9st. A 3. \u00e9s 4. grafikonon l\u00e1thatja a TPI \u00e9s NM$ \u00f6ssz-teny\u00e9sz\u00e9rt\u00e9k indexek eloszl\u00e1s\u00e1t \u2013 2020 \u00e1prilis\u00e1ban \u2013, \u00f6sszevetve a 2016-ban sz\u00fcletett bik\u00e1k (971 egyed) els\u0151 genomikai \u00e9rt\u00e9kel\u00e9s\u00e9vel. A narancss\u00e1rga oszlop a referencia\u00e9rt\u00e9ket jel\u00f6li, vagyis a 0 indexpont v\u00e1ltoz\u00e1st.<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    A 2016-ban sz\u00fcletett 971 bika 2020 \u00e1prilis\u00e1ban \u00e1tlagosan -115 TPI ponttal t\u00e9rt el az els\u0151 genomikai \u00e9rt\u00e9kel\u00e9s\u00e9t\u0151l. K\u00f6r\u00fclbel\u00fcl 140 bik\u00e1n\u00e1l a k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9g mind\u00f6ssze \u00b130 indexpont volt, \u00e9s csak 30 bika nyert vagy vesztett 300-n\u00e1l t\u00f6bb indexpontot.<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    Ugyanezt a trendet l\u00e1tjuk a 4. grafikonon az NM$ eset\u00e9ben is \u2013 ugyanarr\u00f3l a 971, 2016-ban sz\u00fcletett bik\u00e1r\u00f3l van sz\u00f3. Az \u00e1tlagos v\u00e1ltoz\u00e1s -70 indexpont volt, amikor az els\u0151 genomikai teszteket \u00f6sszevetett\u00fck a 2020 \u00e1prilisi le\u00e1nytesztekkel. K\u00f6r\u00fclbel\u00fcl 160 bika csak legfeljebb 20 indexpontot vesztett vagy nyert, \u00e9s mind\u00f6ssze 13 bika eset\u00e9ben volt 300 vagy ann\u00e1l nagyobb v\u00e1ltoz\u00e1s.<\/p>\n

    Az al\u00e1bbi t\u00e1bl\u00e1zatban azt l\u00e1thatjuk, mi t\u00f6rt\u00e9nik, ha \u00f6sszehasonl\u00edtjuk a k\u00edn\u00e1latunkb\u00f3l a t\u00edz legjobban rangsorolt, le\u00e1nyokon tesztelt (progeny) \u00e9s a t\u00edz legjobban rangsorolt genomikai bik\u00e1t. Az \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1s semleges alapj\u00e1ul az NM$ indexet v\u00e1lasztottuk.<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

    A le\u00e1nyokon tesztelt (progeny), magas megb\u00edzhat\u00f3s\u00e1g\u00fa bik\u00e1k legjobb csoportj\u00e1nak \u00e1tlaga 621 NM$ indexpont. Az NM$ alapj\u00e1n legjobban rangsorolt genomikai bik\u00e1k csoportj\u00e1nak \u00e1tlaga 776 indexpont, alacsonyabb tesztmegb\u00edzhat\u00f3s\u00e1ggal. A k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9g 155 indexpont, azaz 155 doll\u00e1r a genomikai bik\u00e1k jav\u00e1ra. M\u00e9g a legjobban rangsorolt le\u00e1nytesztelt bika, az AltaTOPSHOT sem \u2013 amely 2020 \u00e1prilis\u00e1ban a vil\u00e1g m\u00e1sodik legjobban rangsorolt le\u00e1nytesztelt bik\u00e1ja volt 766 NM$ \u00e9rt\u00e9kkel \u2013 \u00e9rte el a genomikai bik\u00e1k csoportj\u00e1nak \u00e1tlag\u00e1t. Elker\u00fclhetetlen, hogy a jobb oldali list\u00e1n szerepl\u0151 genomikai bik\u00e1k k\u00f6z\u00fcl n\u00e9h\u00e1ny vesz\u00edtsen indexpontokat, ez\u00e9rt a genomikai bik\u00e1kat mindig csoportban haszn\u00e1ljuk, hogy elker\u00fclj\u00fck a haszn\u00e1latukb\u00f3l ered\u0151 szelekci\u00f3s kock\u00e1zatot. Nincs re\u00e1lis es\u00e9ly arra, hogy a jobb oldali list\u00e1n szerepl\u0151 \u00f6sszes bika az \u00e1tlagos le\u00e1nytesztelt bikacsoport szintje al\u00e1 essen \u2013 ez gyakorlatilag lehetetlen.<\/strong><\/p>\n

    Genomikai bik\u00e1k haszn\u00e1latakor az al\u00e1bbiakat \u00e9rdemes szem el\u0151tt tartani:<\/strong><\/p>\n

      \n
    1. A genomikai tesztekben szerepl\u0151 \u00e9rt\u00e9kel\u00e9sek m\u00e9g mindig enyh\u00e9n t\u00falbecs\u00fcltek. Ugyanakkor az elemz\u00e9si modellek matematikai fejleszt\u00e9s\u00e9vel a genomikai tesztek \u00e9s a le\u00e1nytesztek (progeny) megb\u00edzhat\u00f3s\u00e1ga k\u00f6z\u00f6tti k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9g gyorsan cs\u00f6kken.<\/li>\n
    2. F\u00fcggetlen\u00fcl att\u00f3l, hogy \u00e1tlagosan cs\u00f6kkennek a TPI \u00e9s NM$ \u00f6ssz-teny\u00e9sz\u00e9rt\u00e9kek a bika els\u0151 genomikai tesztj\u00e9t\u0151l az els\u0151 le\u00e1nyok megjelen\u00e9s\u00e9ig, genomikai bik\u00e1k csoportj\u00e1nak haszn\u00e1lat\u00e1val m\u00e9g \u00edgy is nagyobb genetikai el\u0151rehalad\u00e1st \u00e9r el, mint ha le\u00e1nytesztelt bik\u00e1kat haszn\u00e1lna.<\/li>\n
    3. A genomikai bik\u00e1kat legal\u00e1bb 3-as csoportban kell haszn\u00e1lni, k\u00edv\u00e1natos, hogy legal\u00e1bb 5 legyen; ide\u00e1lis esetben \u00e9vente k\u00e9t 5-\u00f6s csoport, hogy megossz\u00e1k a kisebb megb\u00edzhat\u00f3s\u00e1g\u00fa tesztek haszn\u00e1lat\u00e1val j\u00e1r\u00f3 szelekci\u00f3s kock\u00e1zatot.<\/li>\n
    4. Ahhoz, hogy biztos lehessen benne, a genetikai el\u0151rehalad\u00e1s a megfelel\u0151 (k\u00edv\u00e1nt) ir\u00e1nyba halad, fontos a genomikai bik\u00e1k tervszer\u0171 kiv\u00e1laszt\u00e1sa, egy\u00e9rtelm\u0171 szelekci\u00f3s krit\u00e9riumok \u00e9s c\u00e9lok ment\u00e9n. A felgyorsult genetikai el\u0151rehalad\u00e1s k\u00f6nnyen felgyorsult genetikai visszaes\u00e9ss\u00e9 v\u00e1lhat, ha rossz bik\u00e1kat v\u00e1laszt.<\/li>\n<\/ol>\n

      A szelekci\u00f3 lass\u00fa folyamat, amelynek eredm\u00e9nyeit csak 3,5 \u00e9vvel a tehenek vagy \u00fcsz\u0151k term\u00e9keny\u00edt\u00e9se ut\u00e1n l\u00e1tja. Ez azt jelenti, hogy a ma elk\u00f6vetett hib\u00e1k k\u00f6vetkezm\u00e9nyeivel csak 3 \u00e9s f\u00e9l \u00e9v m\u00falva szembes\u00fcl. Azok a tejtermel\u0151k, akik \u00fagy d\u00f6nt\u00f6ttek, hogy b\u00edznak a genomikai elemz\u00e9sben \u00e9s azt a gyorsabb genetikai el\u0151rehalad\u00e1s el\u00e9r\u00e9s\u00e9re haszn\u00e1lj\u00e1k, m\u00e1r most el\u0151nyben vannak azokkal szemben, akik nem haszn\u00e1lnak genomikai bik\u00e1kat. H\u00e1nyszor kell m\u00e9g 3,5 \u00e9vet v\u00e1rnia ahhoz, hogy utol\u00e9rje \u0151ket?<\/p>\n

      Vladan \u0106iri\u0107<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

      Az emberi DNS szekven\u00e1l\u00e1s\u00e1n (dek\u00f3dol\u00e1s\u00e1n) v\u00e9gzett munka 2001-ben ker\u00fclt publik\u00e1l\u00e1sra. Nagyon hamar, m\u00e1r 2002-ben a genetikusok felismert\u00e9k, hogy a g\u00e9nek elemz\u00e9s\u00e9nek a szarvasmarh\u00e1n\u00e1l is lehet gyakorlati alkalmaz\u00e1sa, \u00e9s megindultak a kutat\u00e1sok.<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":11524,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[32],"tags":[],"class_list":["post-11525","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-a-bikakrol"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11525","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11525"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11525\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":11526,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11525\/revisions\/11526"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/media\/11524"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11525"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11525"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11525"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}