{"id":11474,"date":"2022-03-31T07:04:06","date_gmt":"2022-03-31T06:04:06","guid":{"rendered":"https:\/\/semexpkbb.com\/?p=11474"},"modified":"2026-02-21T07:14:40","modified_gmt":"2026-02-21T06:14:40","slug":"a-rokonsagi-kontroll-jelentosege-a-szarvasmarha-szelekcioban-a-rokonsag-meresenek-modern-modszerei","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/a-rokonsagi-kontroll-jelentosege-a-szarvasmarha-szelekcioban-a-rokonsag-meresenek-modern-modszerei\/","title":{"rendered":"A rokons\u00e1gi kontroll jelent\u0151s\u00e9ge a szarvasmarha-szelekci\u00f3ban \u2013 a rokons\u00e1g m\u00e9r\u00e9s\u00e9nek modern m\u00f3dszerei"},"content":{"rendered":"

El\u0151z\u0151 cikk.<\/a> <\/strong>
\nA rokons\u00e1gi szint meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1nak k\u00e9t legfontosabb gyakorlati m\u00f3dszere a genomikai elemz\u00e9s \u00e9s a sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes, sz\u00e1rmaz\u00e1salap\u00fa sz\u00e1m\u00edt\u00e1s.<\/p>\n

<\/p>\n

A genomikai elemz\u00e9s mint az inbriding egy\u00fctthat\u00f3 meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1nak m\u00f3dszere<\/em><\/strong><\/p>\n

A genomikai elemz\u00e9s \u00e9s a genomikai szelekci\u00f3 bevezet\u00e9se a genetikai fejleszt\u00e9si programokba fordul\u00f3pontot jelentett a tej-, kett\u0151s hasznos\u00edt\u00e1s\u00fa \u00e9s h\u00fashaszn\u00fa szarvasmarhafajt\u00e1k teny\u00e9szt\u00e9s\u00e9ben. A kulcsfontoss\u00e1g\u00fa g\u00e9nek, all\u00e9lok, \u00f6r\u00f6kl\u0151d\u00e9si m\u00f3dok \u00e9s szab\u00e1lyoz\u00f3 mechanizmusaik nukleotidszint\u0171 megismer\u00e9s\u00e9nek eredm\u00e9nye a genetikai potenci\u00e1l eddig nem l\u00e1tott n\u00f6veked\u00e9se, mind egyedi, mind popul\u00e1ci\u00f3s szinten. A genomikai elemz\u00e9sb\u0151l sz\u00e1rmaz\u00f3 inform\u00e1ci\u00f3k felhaszn\u00e1l\u00e1sa rendk\u00edv\u00fcl hat\u00e9kony eszk\u00f6znek bizonyult a szelekci\u00f3ban. Emellett a genomikai elemz\u00e9s a legpontosabb inform\u00e1ci\u00f3t ny\u00fajtja az \u00e1llatok sz\u00e1rmaz\u00e1s\u00e1r\u00f3l, ez\u00e9rt rokons\u00e1g-valid\u00e1l\u00e1sra \u00e9s a genetikai variabilit\u00e1s meg\u0151rz\u00e9s\u00e9t c\u00e9lz\u00f3 strat\u00e9gi\u00e1k kidolgoz\u00e1s\u00e1ra is haszn\u00e1lj\u00e1k.<\/p>\n

A sz\u00e1rmaz\u00e1s genomikai valid\u00e1l\u00e1s\u00e1nak sz\u00e1mos el\u0151nye van. Ha tudjuk, hogy az ut\u00f3d g\u00e9njeinek 50%-\u00e1t mindk\u00e9t sz\u00fcl\u0151t\u0151l \u00f6r\u00f6kli, ugyanakkor nem pontosan ugyanazt az 50%-ot, felmer\u00fcl a k\u00e9rd\u00e9s: konkr\u00e9tan mely g\u00e9neket \u00f6r\u00f6k\u00f6lte?<\/strong> Visszat\u00e9rve a Wright\u2013Kislovski-f\u00e9le k\u00e9plethez: az ezzel kapott eredm\u00e9ny annak val\u00f3sz\u00edn\u0171s\u00e9g\u00e9t fejezi ki, hogy az egyed k\u00e9t all\u00e9lja k\u00f6z\u00f6s \u0151st\u0151l sz\u00e1rmazik. Az eredm\u00e9ny azonban nem mutatja meg, hogy a genom mely r\u00e9szei sz\u00e1rmaznak az ap\u00e1t\u00f3l, illetve az any\u00e1t\u00f3l, \u00e9s nem ad pontos k\u00e9pet az egyed t\u00e9nyleges inbriding szintj\u00e9r\u0151l.<\/p>\n

A k\u00f6nnyebb meg\u00e9rt\u00e9s \u00e9rdek\u00e9ben vegy\u00fck ism\u00e9t a 2. p\u00e9ld\u00e1t<\/em>. A borj\u00fa g\u00e9njeinek 50%-\u00e1t az apj\u00e1t\u00f3l, 50%-\u00e1t az anyj\u00e1t\u00f3l \u00f6r\u00f6k\u00f6lte, 25\u201325%-ot a nagysz\u00fcl\u0151kt\u0151l, \u00e9s 12,5%-ot a d\u00e9dsz\u00fcl\u0151i gener\u00e1ci\u00f3 minden egyes tagj\u00e1t\u00f3l, amelyben a k\u00f6z\u00f6s \u0151s is tal\u00e1lhat\u00f3. Az inbriding egy\u00fctthat\u00f3 k\u00e9plete alapj\u00e1n a rokons\u00e1gi szint Fx<\/sub> = 3,38%<\/em>. Ez azt jelenti, hogy 3,38% annak a val\u00f3sz\u00edn\u0171s\u00e9ge, hogy az egyed DNS-\u00e9ben az apa \u00e9s az anya oldal\u00e1r\u00f3l is az AltaSPRING bik\u00e1t\u00f3l sz\u00e1rmaz\u00f3 g\u00e9nek tal\u00e1lhat\u00f3k. Ugyanakkor nem tudjuk, hogy az apa apja \u00e9s az anya anyja k\u00f6zvetetten, illetve az apa \u00e9s az anya k\u00f6zvetlen\u00fcl milyen m\u00e9rt\u00e9kben \u00f6r\u00f6k\u00f6lt\u00e9k a k\u00f6z\u00f6s g\u00e9neket, \u00e9s ebb\u0151l mennyi ker\u00fclt az X borj\u00faba.<\/strong> Itt jelent el\u0151nyt a genomikai elemz\u00e9s, amely azonos\u00edtja a k\u00f6z\u00f6s eredet\u0171 all\u00e9lokat \u00e9s azok \u00f6r\u00f6kl\u00f6tt ar\u00e1ny\u00e1t.<\/strong><\/p>\n

\"\"<\/p>\n

2. p\u00e9lda<\/em><\/p>\n

Az \u00e1llatok genotipiz\u00e1l\u00e1s\u00e1nak folyamata t\u00f6bb l\u00e9p\u00e9sb\u0151l \u00e1ll:<\/p>\n

    \n
  1. Sz\u00f6vetminta v\u00e9tele (sz\u0151r, v\u00e9r, porc, sperma)<\/li>\n
  2. DNS izol\u00e1l\u00e1sa a mint\u00e1b\u00f3l<\/li>\n
  3. A popul\u00e1ci\u00f3s adatb\u00e1zist tartalmaz\u00f3 chip \u00e9s az egyed DNS-\u00e9nek \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1sa<\/li>\n
  4. A markerek hat\u00e1s\u00e1nak \u00e9rt\u00e9kel\u00e9se SNP-egyenletek modelljeivel<\/li>\n
  5. Az eredm\u00e9nyek felhaszn\u00e1l\u00e1sa a genomikai teny\u00e9sz\u00e9rt\u00e9k (GEBV \u2013 Genomic Estimated Breeding Value) meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1ra<\/li>\n<\/ol>\n

    A genomikai elemz\u00e9s sor\u00e1n a vizsg\u00e1lt egyed DNS-\u00e9t \u00f6sszevetik egy referenciapopul\u00e1ci\u00f3 adatait tartalmaz\u00f3 chippel. Az SNP-k (Single Nucleotide Polymorphism \u2013 egy nukleotid polimorfizmus) molekul\u00e1ris markerek, amelyek alkalmasak a DNS-szekvenciavari\u00e1ci\u00f3k automatikus kimutat\u00e1s\u00e1ra. Az SNP-modellek figyelembe veszik a nukleotidok elrendez\u0151d\u00e9s\u00e9t \u00e9s k\u00f6lcs\u00f6nhat\u00e1sait a DNS-l\u00e1ncban, \u00edgy meghat\u00e1rozhat\u00f3 a vizsg\u00e1lt \u00e1llat SNP-genot\u00edpusa.<\/p>\n

    A megb\u00edzhat\u00f3 genomikai eredm\u00e9nyek alapfelt\u00e9tele a megfelel\u0151en nagy referenciapopul\u00e1ci\u00f3. M\u00e9rete az adott tulajdons\u00e1g \u00f6r\u00f6k\u00f6lhet\u0151s\u00e9g\u00e9t\u0151l f\u00fcgg: min\u00e9l alacsonyabb a heritabilit\u00e1s, ann\u00e1l nagyobb popul\u00e1ci\u00f3 sz\u00fcks\u00e9ges a megb\u00edzhat\u00f3 eredm\u00e9nyekhez. Ez egyben a genomikai elemz\u00e9s egyik f\u0151 h\u00e1tr\u00e1nya is, mivel a referenciapopul\u00e1ci\u00f3 kialak\u00edt\u00e1sa jelent\u0151s anyagi \u00e9s szakmai r\u00e1ford\u00edt\u00e1st ig\u00e9nyel. Ez\u00e9rt a genomikai elemz\u00e9s el\u0151sz\u00f6r a holstein, sziment\u00e1li \u00e9s h\u00fashaszn\u00fa popul\u00e1ci\u00f3kban terjedt el, \u00e9s nemr\u00e9giben v\u00e1llalatunk k\u00f6zvet\u00edt\u00e9s\u00e9vel a szerbiai gazd\u00e1k sz\u00e1m\u00e1ra is el\u00e9rhet\u0151v\u00e9 v\u00e1lt.<\/strong><\/p>\n

    Sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes szoftverek az inbriding egy\u00fctthat\u00f3 sz\u00e1m\u00edt\u00e1s\u00e1ra<\/em><\/strong><\/p>\n

    A genomikai elemz\u00e9s mellett \u2013 a globaliz\u00e1ci\u00f3, a mesters\u00e9ges term\u00e9keny\u00edt\u00e9s (AI) \u00e9s az embri\u00f3transzfer (ET) elterjed\u00e9se, valamint a pedigr\u00e9k bonyolults\u00e1g\u00e1nak n\u00f6veked\u00e9se miatt \u2013 olyan szoftverek ker\u00fcltek fejleszt\u00e9sre, amelyek egyedi \u00e9s popul\u00e1ci\u00f3s szinten is k\u00e9pesek a rokons\u00e1g meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1ra. El\u0151ny\u00fck a gyorsas\u00e1g \u00e9s az alacsonyabb k\u00f6lts\u00e9g a genomikai elemz\u00e9shez k\u00e9pest.<\/p>\n

    Ezek a programok Wright k\u00e9plet\u00e9n alapulnak az inbriding egy\u00fctthat\u00f3 sz\u00e1m\u00edt\u00e1s\u00e1ra, ugyanakkor sokkal t\u00f6bb k\u00f6z\u00f6s \u0151si kapcsolatot tudnak figyelembe venni. A pontos sz\u00e1m\u00edt\u00e1si modell a fejleszt\u0151 c\u00e9gek know-how-ja.<\/p>\n

    Kiv\u00e1l\u00f3 p\u00e9lda erre az AltaGPS<\/strong>, amely genetikai pozicion\u00e1l\u00e1si, szelekci\u00f3s, p\u00e1ros\u00edt\u00e1si \u00e9s rokons\u00e1gellen\u0151rz\u00e9si szoftver brown swiss, holstein \u00e9s jersey \u00e1llom\u00e1nyok sz\u00e1m\u00e1ra. H\u00e1rom gener\u00e1ci\u00f3 f\u00e9rfi\u00e1gi \u0151seinek adatai alapj\u00e1n sz\u00e1m\u00edtja a rokons\u00e1gi egy\u00fctthat\u00f3t, ami az eredet 87,5%-\u00e1t fedi le (3. p\u00e9lda<\/em>).<\/p>\n

    \"\"<\/p>\n

     <\/p>\n

    3. p\u00e9lda<\/em><\/p>\n

    Minden gazda, aki egy\u00fcttm\u0171k\u00f6dik v\u00e1llalatunkkal, a sperma mell\u00e9 egy term\u00e9keny\u00edt\u00e9si tervet is kap. Az AltaGPS szoftverrel k\u00e9sz\u00edtett jelent\u00e9s tartalmazza az egyedi, az \u00e1llom\u00e1nyszint\u0171 \u00e9s a tervezett p\u00e1ros\u00edt\u00e1sokb\u00f3l sz\u00e1rmaz\u00f3 ut\u00f3dok inbriding egy\u00fctthat\u00f3j\u00e1nak becsl\u00e9s\u00e9t is.<\/strong><\/p>\n

    Vladan \u0106iri\u0107
    \n2021. m\u00e1rcius<\/p>\n

     <\/p>\n

    Folytat\u00e1s … <\/strong><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

    El\u0151z\u0151 cikk. A rokons\u00e1gi szint meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1nak k\u00e9t legfontosabb gyakorlati m\u00f3dszere a genomikai elemz\u00e9s \u00e9s a sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9pes, sz\u00e1rmaz\u00e1salap\u00fa sz\u00e1m\u00edt\u00e1s.<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":11473,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[32],"tags":[],"class_list":["post-11474","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-a-bikakrol"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11474","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11474"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11474\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":11475,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11474\/revisions\/11475"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/media\/11473"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11474"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11474"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semexpkbb.com\/hu\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11474"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}